数据集概述
本数据集为论文“Genetic structure and effective population size of Sydney rock oysters in eastern Australia”的配套数据，包含牡蛎基因型VCF文件、样本元数据、分析脚本及种群统计模型压缩包，覆盖澳大利亚东部悉尼岩牡蛎的遗传结构与有效种群大小研究相关信息，共四个文件。
文件详解
- VCF文件
- 文件名称：OHare_et_al_363_75231_biallelic.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍：包含363个样本的基因型信息，过滤后保留75231个双等位基因SNP位点，符合论文中SNP calling方法的处理标准
- 样本元数据文件
- 文件名称：OHare_et_al_Sample_Metadata.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含SITE（采样点ID）、INDIVIDUAL（个体ID）、LATITUDE（纬度）、LONGITUDE（经度）等字段，记录样本的采样位置信息
- 分析脚本文件
- 文件名称：OHare_et_al_Data_Script.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：论文中用于生成数据和执行分析的主脚本
- 种群统计模型压缩包
- 文件名称：Moments_modelling.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含与种群统计建模相关的文件，使用moments工具进行分析
数据来源
论文“Genetic structure and effective population size of Sydney rock oysters in eastern Australia”（DOI: 10.1007/s10592-021-01343-4）
适用场景
- 牡蛎种群遗传学研究：分析悉尼岩牡蛎的遗传结构、基因流及有效种群大小
- 海洋生物地理分布分析：结合样本元数据中的经纬度信息，研究牡蛎种群的地理分布规律
- 种群统计模型验证：利用moments建模文件，复现或扩展论文中的种群动态分析
- 遗传多样性保护：基于基因型数据评估牡蛎种群的遗传多样性，为保护策略制定提供支持
- 生物信息学方法应用：参考分析脚本，学习牡蛎遗传数据的处理与分析流程
