数据集概述
本数据集为OME-Zarr格式的人类诱导多能干细胞(hiPSC)3D免疫荧光图像测试子集,包含1个DAPI核染色通道,2个视野的2个Z层图像及相关元数据,用于OME-Zarr处理流程的自动化测试。
文件详解
- 20200812-CardiomyocyteDifferentiation14-Cycle1.zarr.zip:ZIP格式,3D版本OME-Zarr文件,包含2个Z平面的原始图像数据
- 20200812-CardiomyocyteDifferentiation14-Cycle1_mip.zarr.zip:ZIP格式,2D版本OME-Zarr文件,为Z平面最大强度投影(MIP),含Cellpose分割标签图像、测量数据及ROI表
- fractal_workflow.json:JSON格式,Fractal处理工作流文件,包含工作流名称(name)和任务列表(task_list)字段
数据来源
Pelkmans lab
适用场景
- OME-Zarr数据处理工具的自动化测试与验证
- 生物图像分析流程(如细胞分割、特征提取)的开发与调试
- 高内涵成像实验数据标准化存储格式的研究
- 干细胞免疫荧光图像分析算法的性能评估