OME_Zarr人类诱导多能干细胞3D免疫荧光图像测试集2020

数据集概述

本数据集为OME-Zarr格式的人类诱导多能干细胞(hiPSC)3D免疫荧光图像测试子集,包含1个DAPI核染色通道,2个视野的2个Z层图像及相关元数据,用于OME-Zarr处理流程的自动化测试。

文件详解

  • 20200812-CardiomyocyteDifferentiation14-Cycle1.zarr.zip:ZIP格式,3D版本OME-Zarr文件,包含2个Z平面的原始图像数据
  • 20200812-CardiomyocyteDifferentiation14-Cycle1_mip.zarr.zip:ZIP格式,2D版本OME-Zarr文件,为Z平面最大强度投影(MIP),含Cellpose分割标签图像、测量数据及ROI表
  • fractal_workflow.json:JSON格式,Fractal处理工作流文件,包含工作流名称(name)和任务列表(task_list)字段

数据来源

Pelkmans lab

适用场景

  • OME-Zarr数据处理工具的自动化测试与验证
  • 生物图像分析流程(如细胞分割、特征提取)的开发与调试
  • 高内涵成像实验数据标准化存储格式的研究
  • 干细胞免疫荧光图像分析算法的性能评估
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 46.18 MiB
最后更新 2025年12月13日
创建于 2025年12月13日
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