Oncorhynchus_mykiss_Based_虹鳟鱼谱系与栖息地自然选择标记数据

数据集概述

本数据集包含虹鳟鱼（Oncorhynchus mykiss）的基因组SNP标记数据，基于美国西北部及不列颠哥伦比亚省11个溯河洄游与定居种群的805个个体，筛选276个单核苷酸多态性位点，用于分析谱系间及栖息地的自然选择信号，重点关注免疫相关基因（如MHC II类基因）的适应性分化，为鱼类进化与适应性研究提供资源。

文件详解

• 文件名称：Limborg et al. 2012_Oncorhyncus mykiss_SNP data.xlsx
• 文件格式：XLSX
• 字段映射介绍：包含虹鳟鱼种群SNP基因分型数据，涉及805个个体的276个SNP位点信息，覆盖11个种群的谱系与栖息地背景，可用于分析遗传分化、选择信号及环境相关性（如温度）等研究场景。

适用场景

• 鱼类适应性进化研究: 分析虹鳟鱼谱系间及栖息地的自然选择信号，探究遗传分化机制。
• 免疫相关基因功能研究: 基于MHC II类基因的非同义突变多样性，研究免疫适应性与平衡选择机制。
• 环境关联分析: 结合温度等景观因子，解析基因组位点与环境因子的相关性。
• 种群遗传结构研究: 利用SNP标记分析溯河洄游与定居种群的遗传差异及地理隔离效应。