数据集概述
该数据集包含多种类型的文件,涵盖化学结构参数数据(如键长、角度、二面角等)、可视化图表(PNG格式)、代码文件、配置文件及压缩数据,为相关研究提供多维度的数据支持。
文件详解
- 数据文件(CSV格式):
- icrmsd.csv:包含键长(Bond)、角度(Angle)、二面角(Dihedral)、非正则二面角(Improper)等化学结构参数数据
- dde.csv:包含差值(difference)数据
- rmsd.csv:可能包含均方根偏差相关数据
- tfd.csv:可能包含目标函数差值相关数据
- 可视化文件(PNG格式):
- rmsd.png、dde.png、tfd.png、rmsd_cdf.png、angles.png等共9个图片文件,用于展示数据可视化结果
- 代码文件(PY格式):
- main.py:可能为数据处理或分析的主程序代码
- 其他文件:
- cache.json:JSON格式缓存文件
- tmp.sqlite.bz2:压缩的SQLite数据库文件
- env.yaml:YAML格式环境配置文件
数据来源
openforcefield/yammbs-dataset-submission(https://github.com/openforcefield/yammbs-dataset-submission)
适用场景
- 化学结构分析:用于研究分子键长、角度、二面角等结构参数的分布特征
- 计算化学研究:支持分子动力学模拟结果的验证与分析
- 数据可视化研究:可用于测试或改进化学数据可视化方法
- 代码复现:辅助相关计算程序的运行环境配置与结果复现