数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫CB151 unc-3(e151)X突变体的行为实验记录,属于C.elegans行为数据库的一部分。包含实验环境参数、视频追踪数据及行为特征文件,记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为表现,可用于研究unc-3基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:
unc-3 (e151)X on food R_2011_10_18__11_26_40___6___1_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:可能包含线虫行为特征数据,如运动轨迹、身体姿态、速度等经tierpsy软件提取的特征参数
- 文件名称:
unc-3 (e151)X on food R_2011_10_18__11_26_40___6___1.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:可能包含实验原始追踪数据,如每帧线虫的位置、骨架坐标等基础数据
- 文件名称:
unc-3 (e151)X on food R_2011_10_18__11_26_40___6___1.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:可能包含WCON格式的行为数据压缩文件,WCON格式通常用于存储线虫行为追踪的标准化数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究: 分析unc-3基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为、觅食行为等表型的影响
- 神经生物学实验验证: 结合基因功能研究,验证unc-3基因在神经发育或行为调控中的作用
- 行为学实验方法优化: 参考实验方案(如habituation时长、培养基类型),优化线虫行为实验设计
- 模式生物行为数据库补充: 为秀丽隐杆线虫行为数据库提供标准化的突变体行为数据样本
- 生物信息学分析: 利用HDF5格式的行为特征数据,开展线虫行为模式的机器学习或统计分析