数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了VC1024品系(pdr-1(gk448) III)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂培养皿中的行为实验数据。实验通过tierpsy软件追踪线虫运动,包含视频处理后的特征数据、运动轨迹等结构化信息,可用于分析pdr-1基因对线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:
pdr-1(gk448)) on food R_2012_08_31__14_38_34__12.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测包含线虫行为追踪的原始或中间数据,如视频帧对应的运动参数、骨架坐标等(具体字段未明确说明)
- 文件名称:
pdr-1(gk448)) on food R_2012_08_31__14_38_34__12.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含WCON格式文件)
- 字段映射介绍:WCON格式通常用于存储线虫行为数据,可能包含运动轨迹、速度、弯曲度等标准化行为特征
- 文件名称:
pdr-1(gk448)) on food R_2012_08_31__14_38_34__12_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验提取的行为特征数据,对应20913个分割骨架,涉及运动速度、身体弯曲度、轨迹方向等行为学指标
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究: 分析pdr-1基因缺失(gk448突变)对线虫运动行为的影响
- 模式生物行为学分析: 研究成年雌雄同体线虫在食物存在下的觅食、运动轨迹特征
- 基因功能注释: 结合pdr-1基因功能,探索其在调控线虫行为中的作用机制
- 行为学实验方法验证: 参考E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为追踪技术的可靠性
- 神经科学研究: 关联pdr-1基因与线虫神经系统功能,分析行为表型的神经基础