数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了ins-3(tm3608)突变株成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2012年10月31日开展,使用NGM低蛋白胨琼脂培养基和OP50食物源,通过tierpsy软件追踪分析线虫行为,包含原始追踪、特征提取及标准化格式三种文件,用于线虫遗传学与行为学研究。
文件详解
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:
ins-3 (tm3608) on food L_2012_10_31__11_58_08___4___7.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为的原始追踪数据,包含视频帧层面的线虫位置、形态等基础数据
- 特征提取数据文件
- 文件名称:
ins-3 (tm3608) on food L_2012_10_31__11_58_08___4___7_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:基于原始追踪数据提取的线虫行为特征数据,涵盖运动、姿态等量化指标
- 标准化格式压缩文件
- 文件名称:
ins-3 (tm3608) on food L_2012_10_31__11_58_08___4___7.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(包含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:采用wcon标准化格式存储的线虫行为数据压缩包,便于跨平台数据交换与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析ins-3基因缺失对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 行为学特征分析:基于特征数据研究线虫的运动模式、觅食行为等量化指标
- 实验方法验证:参考E. Yemini等人的实验方案,验证线虫行为实验的标准化流程
- 模式生物数据库补充:作为OpenWorm项目的一部分,丰富秀丽隐杆线虫行为数据库资源