数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫品系MT1079 egl-15(n484)X的行为实验数据,记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基上的运动行为,包含视频追踪数据及特征提取结果,属于C.elegans行为数据库的一部分。
文件详解
- 文件名称:
egl-15 (n484)X on food R_2010_05_11__11_46_17___8___3_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测包含线虫行为特征数据,如运动轨迹、速度、身体弯曲度等经tierpsy软件提取的特征参数
- 文件名称:
egl-15 (n484)X on food R_2010_05_11__11_46_17___8___3.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:推测包含线虫行为的标准化运动数据,符合Worm Behavior Ontology规范
- 文件名称:
egl-15 (n484)X on food R_2010_05_11__11_46_17___8___3.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测包含原始视频追踪数据,如19319个分割骨架的坐标信息、时间戳等基础数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为遗传学研究: 分析egl-15基因变异对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 分子生物学实验验证: 验证E. Yemini等人提出的线虫行为实验方法的可重复性
- 线虫运动特征提取算法优化: 基于tierpsy软件输出的特征数据,优化线虫行为特征提取模型
- 模式生物行为数据库构建: 作为标准化线虫行为数据案例,支持C.elegans行为数据库的扩展与完善