数据集概述
本数据集来源于一项前瞻性病例对照研究,旨在评估流行区猫后睾吸虫感染儿童(50例)在吡喹酮治疗前后及未感染儿童(49例)的肠道菌群变化。研究纳入99名7-18岁儿童,通过16S rRNA基因测序分析粪便样本菌群,发现感染组与对照组在细菌分类群丰度上存在显著差异,治疗后部分菌群丰度发生改变。数据集包含307个文件,核心为测序数据和表型数据。
文件详解
- 测序数据文件
- 文件名称:如TGU.11190115.repl1.fastq.gz、TGU.11270115.repl1.fastq.gz等
- 文件格式:fastq.gz
- 字段映射介绍:共306个压缩文件,为儿童粪便样本的16S rRNA基因测序原始数据,包含reads序列及质量信息,用于肠道菌群的物种组成和多样性分析
- 表型数据文件
- 文件名称:phenotype_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:1个Excel文件,推测包含研究对象的基本信息、感染状态、治疗情况及临床表型数据,为测序数据提供对应的样本表型注释
适用场景
- 寄生虫感染肠道菌群机制研究:分析猫后睾吸虫感染对儿童肠道菌群组成、丰度及多样性的影响
- 驱虫治疗肠道菌群恢复评估:探究吡喹酮治疗后儿童肠道菌群的动态变化及恢复趋势
- 宿主-寄生虫-菌群互作分析:研究流行区儿童宿主、寄生虫感染与肠道菌群的相互作用关系
- 临床微生物组应用:为寄生虫感染相关肠道菌群失调的诊断及治疗靶点开发提供数据支持