数据集概述
本数据集为研究猩猩种群历史重建的5个压缩文件，包含ABC脚本、输入文件、统计摘要、微卫星基因型及序列比对数据。利用贝叶斯计算方法，分析婆罗洲和苏门答腊猩猩的遗传变异模式，探索其因气候、火山活动及人类活动导致的复杂种群历史，适用于种群遗传学与进化生物学研究。
文件详解
- ABC_scripts.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容：包含用于近似贝叶斯计算（ABC）分析的脚本文件，用于测试不同种群历史场景的模型拟合度
- ABC_inputfiles.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容：包含ABC分析所需的输入数据文件，支持对12种种群历史场景的模拟与验证
- ABC_summarystatistics.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容：包含ABC分析得到的统计摘要数据，反映猩猩群体遗传变异的关键统计特征
- Microsatellite_genotypes.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容：包含猩猩群体的微卫星基因型数据，用于种群遗传结构与多样性分析
- Sequence_alignments.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容：包含猩猩的序列比对数据，覆盖常染色体、X染色体、线粒体及Y染色体标记，反映不同基因组区域的遗传变异模式
数据来源
论文“Reconstructing the demographic history of orang-utans using approximate Bayesian computation”
适用场景
- 种群遗传学研究: 分析猩猩种群的遗传结构、分化时间及基因流模式，探索其复杂的种群历史
- 进化生物学分析: 研究气候变迁、火山活动及人类活动对猩猩种群动态的影响机制
- 贝叶斯计算方法应用: 验证近似贝叶斯计算（ABC）在复杂种群历史模型中的拟合效果
- 保护遗传学研究: 为猩猩的保护策略制定提供种群历史与遗传多样性的科学依据
- 比较基因组学分析: 对比不同基因组区域（常染色体、性染色体、线粒体）的遗传变异模式，揭示进化驱动力差异
