数据集概述
本数据集为鸭茅（Dactylis glomerata L.）热胁迫下的转录组分析数据，包含耐热基因型‘Baoxing’和热敏感基因型‘01998’的差异表达基因（DEGs）信息，以及单核苷酸多态性（SNPs）、简单序列重复（SSRs）等分子标记数据，共16个文件，可用于鸭茅耐热机制研究与分子标记开发。
文件详解
- 说明文档（.docx格式，共10个）
- 文件名称：README_for_SNPs upload.docx、README_for_Aligned sequences for SNP validation.docx、README_for_Differential_analysis_results.docx、README_for_Genotyping results for SSR validation.docx、README_for_Readcount_FPKM.docx、README_for_SSR upload.docx、README_for_The results of qRT-PCR for validated genes.docx、README_for_unigene upload.docx、Aligned sequences for SNP validation.docx、The results of qRT-PCR for validated genes.docx
- 内容：对应各数据文件的说明文档，涵盖SNPs上传、SNP验证比对序列、差异分析结果、SSR验证基因分型结果、Readcount与FPKM值、SSR上传、qRT-PCR验证结果、unigene上传等内容的说明
- 数据文件（.xlsx/.xls/.fasta格式，共3个）
- 文件名称：SSR upload.xlsx、Genotyping results for SSR validation.xlsx、SNPs upload.xls、unigene upload.fasta
- 内容：SSR分子标记数据、SSR验证基因分型结果、SNPs分子标记数据、鸭茅unigene序列数据
- 压缩文件（.zip格式，共2个）
- 文件名称：Differential_analysis_results.zip、Readcount_FPKM.zip
- 内容：热胁迫下差异表达基因分析结果、基因表达量Readcount与FPKM值数据
数据来源
论文“Identifying differentially expressed genes under heat stress and developing molecular markers in orchardgrass (Dactylis glomerata L.) through transcriptome analysis”
适用场景
- 鸭茅耐热基因功能研究: 分析热胁迫下差异表达基因（DEGs），探究鸭茅耐热分子机制
- 分子标记辅助育种: 利用SNPs和SSR分子标记数据，开展鸭茅耐热品种的分子标记辅助选择
- 基因表达分析: 通过Readcount与FPKM值数据，研究鸭茅基因在热胁迫下的表达模式
- 分子标记验证: 基于SNP/SSR验证数据，优化鸭茅分子标记的准确性与适用性
- 转录组数据挖掘: 利用unigene序列数据，进行鸭茅功能基因的注释与挖掘
