数据集概述
本数据集聚焦北美西部俄勒冈歌雀的快速谱系分化过程，包含基因组水平的SNP位点数据及环境变量数据，用于研究中性漂移与局部适应性在种群分化中的相对作用，涉及孤立干旱山区种群与湿润北部种群的遗传结构差异，支持遗传-环境关联分析。
文件详解
- 基因组变异数据文件（.vcf格式，共4个）
- 文件名称：ORJUSTRUx8_biall_dp450_q40_perpopmiss075_hwe00001_maf002_LD02_neutral01.vcf、ORJU06x12_biall_dp450_q40_maf002_nomissing_hwe00001_noZ_neutral01.vcf、ORJU06x12_biall_dp450_q40_maf002_nomissing_hwe00001_noZ.vcf、ORJU06x12_biall_dp450_q40_maf002_nomissing_hwe00001_sel01_BAYESCENV.vcf
- 字段映射介绍：包含双等位基因SNP位点信息，涵盖测序深度、质量值、位点缺失率、哈迪-温伯格平衡过滤、最小等位基因频率、连锁不平衡过滤、中性/选择位点标记等筛选条件相关的基因组变异数据
- 基因型似然数据文件（.beagle.gz格式，共1个）
- 文件名称：genolike_map20_q20_snp16_maf002_ind32_430K.beagle.gz
- 字段映射介绍：包含32个个体的43万余个SNP位点基因型似然数据，涉及图谱版本、质量值、SNP密度、最小等位基因频率等筛选参数
- 地理与环境数据文件（.xlsx格式，共2个）
- 文件名称：ORJUGEO_coords_ALLSAMPLES.xlsx、ORJUGEO_coords_ClimVariables.xlsx
- 字段映射介绍：分别包含所有样本的地理坐标信息、地理坐标对应的气候变量数据
数据来源
论文“Genome-wide signals of drift and local adaptation during rapid lineage divergence in a songbird”
适用场景
- 进化遗传学研究: 分析歌雀种群分化中中性漂移与局部适应性的相对贡献
- 遗传-环境关联分析: 探究温度、降水、海拔、植被等环境因子与基因组变异的关联
- 种群遗传结构解析: 研究孤立山区与北部扩张种群的遗传差异及分化模式
- 适应性进化位点筛选: 识别受选择的基因组位点，分析局部适应的分子机制
- 生物地理学研究: 结合地理坐标与遗传数据，探讨歌雀种群的地理分布与进化历史关联
