Oreochromis_niloticus_Based刚果民主共和国引入种群基因组研究数据集

数据集概述

本数据集用于研究刚果民主共和国引入的尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)种群基因组特征,包含213份尼罗罗非鱼样本(来自原生及引入区域)和48份其他罗非鱼物种样本的基因分型数据,通过RAD测序获得27611个SNP位点,可分析种群分化、遗传混杂及入侵后果。

文件详解

  • 文件名称:README.docx
  • 文件格式:DOCX
  • 字段映射介绍:包含数据集研究背景、样本信息、实验方法、数据分析流程及结果说明等文档内容
  • 文件名称:GATK_Filter_Paralogues_1SNP_Q30.recode.vcf
  • 文件格式:VCF
  • 字段映射介绍:经GATK过滤的单核苷酸多态性(SNP)数据文件,包含样本基因型、位点质量值(Q30)、过滤参数(排除 paralogues 及保留单一位点)等基因组数据

适用场景

  • 入侵物种种群基因组分析: 研究刚果民主共和国尼罗罗非鱼的种群分化、遗传结构及引入来源
  • 物种间遗传混杂检测: 分析尼罗罗非鱼与其他罗非鱼物种的杂交情况及遗传完整性影响
  • 水产养殖入侵后果评估: 评估尼罗罗非鱼引入对原生罗非鱼适应性及生存能力的潜在威胁
  • 基因组数据应用研究: 利用VCF格式的SNP数据开展群体遗传学、进化生物学等相关分析
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 159.19 MiB
最后更新 2026年1月17日
创建于 2026年1月17日
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