数据集概述
本数据集为基于CF_000003625.3_OryCun2.0参考基因组的扩展转录本注释GTF文件压缩包,数据来自家兔肾脏上皮细胞系感染马α疱疹病毒1型的时间进程实验,是2024年Tombácz等人相关研究的补充材料。
文件详解
- 文件名称:Supporting_Data_observed_transcripts.gtf.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:压缩包内包含扩展转录本注释GTF文件,基于CF_000003625.3_OryCun2.0_genomic.gtf参考基因组构建,记录家兔肾脏上皮细胞在EHV-1感染实验中鉴定出的转录本注释信息。
数据来源
论文“Temporal Transcriptional Profiling of Host Cells Infected by a Veterinary Alphaherpesvirus using Nanopore Sequencing”(Tombácz et al, 2024)
适用场景
- 家兔转录组注释优化:用于完善OryCun2.0参考基因组的转录本注释信息,补充病毒感染条件下的转录本数据。
- 病毒-宿主相互作用研究:分析家兔肾脏上皮细胞在EHV-1感染过程中的转录动态变化。
- 分子病毒学机制探索:基于时间进程转录本数据,研究兽医α疱疹病毒感染对宿主细胞转录组的调控机制。
- 纳米孔测序转录组分析验证:作为纳米孔测序技术应用于病毒感染转录组研究的补充数据支撑。