数据集概述
本数据集来源于亚洲野生稻(Oryza rufipogon)群体遗传学研究,包含108份亚洲野生稻样本的42个全基因组序列标签位点(STS)的序列变异数据。研究通过贝叶斯聚类、主成分分析和AMOVA等方法,揭示了两个遗传分化群体(Ruf-I和Ruf-II)的地理渐变模式,支持亚洲栽培稻(O. sativa)在中国的单一起源假说。数据集仅包含一个压缩文件。
文件详解
- 文件名称:sts_rufipogon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩文件包含108份亚洲野生稻样本的42个全基因组序列标签位点(STS)的序列变异数据,具体字段需解压后查看原始数据结构。
数据来源
论文“Phylogeography of Asian wild rice, Oryza rufipogon: a genome-wide view”
适用场景
- 植物群体遗传学研究:分析亚洲野生稻的遗传结构、群体分化及地理渐变模式。
- 栽培稻起源研究:探究亚洲栽培稻(O. sativa)与野生稻的遗传关系,支持单一起源假说。
- 基因组学数据分析:利用STS位点的序列变异数据进行贝叶斯聚类、主成分分析和AMOVA等分析。
- 进化生物学研究:探讨古气候、基因渐渗和迁移-漂变平衡对亚洲野生稻群体遗传结构的影响。