数据集概述
本数据集聚焦欧洲狍免疫遗传异质性研究,包含MHC-DRB基因原始数据、基因型数据、微卫星基因型数据、单倍型序列比对等文件,涉及先天与获得性免疫相关基因(如TLRs、细胞因子编码基因)的遗传变异分析,为研究野生动物免疫基因进化及病原体响应机制提供数据支持。
文件详解
- 原始数据文件
- 文件名称:MHC-DRB_CaCapreolus_454_rawdata.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含欧洲狍MHC-DRB基因的454测序原始数据
- 基因型数据文件
- 文件名称:Roedeer_Immunogenetics_Genotypicdata_Quemereetal_final.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含POP(种群)、ID(个体编号)及TLR2、TLR4、TLR3等免疫相关基因位点的基因型数据
- 微卫星基因型数据文件
- 文件名称:Roedeer_microsatellite_Genotypes_Quemereetal.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含欧洲狍微卫星标记的基因型数据
- 序列比对与分析文件
- 文件名称:DNAsp_phased_input_fasta.zip、unique_haplotypes_fasta_alignement.zip、PAML4_CodeML_infiles.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含用于DNAsp分析的相位输入序列、独特单倍型序列比对结果及PAML4 CodeML分析输入文件
适用场景
- 野生动物免疫遗传学研究:分析欧洲狍免疫相关基因(如TLRs、MHC-DRB)的遗传变异特征
- 进化生物学研究:探究遗传漂变与病原体介导的正选择对免疫基因进化的影响
- 流行病学研究:评估野生动物应对病原体及新兴传染病的免疫遗传潜力
- 种群遗传学分析:结合微卫星数据研究欧洲狍种群遗传结构与免疫基因多样性的关系