数据集概述
本数据集包含18个威尔士本地绵羊品种共353个个体的基因分型数据,采用Illumina OvineSNP50芯片检测,并与国际绵羊基因组联盟HapMap项目的74个全球绵羊品种数据整合分析,旨在探究威尔士绵羊的遗传结构、多样性及与其他欧洲品种的亲缘关系。
文件详解
- 文件名称:Welsh_sheep_genotyping_&_trees.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内含基于Illumina OvineSNP50芯片的威尔士绵羊基因分型原始数据,以及群体结构分析(如聚类、多维尺度分析)、遗传多样性(FST、单倍型共享)、有效群体大小等分析结果文件。
数据来源
论文“Population structure and history of the Welsh sheep breeds determined by whole genome genotyping”及国际绵羊基因组联盟HapMap项目
适用场景
- 绵羊遗传多样性研究:分析威尔士本地绵羊品种的遗传变异水平、群体分化程度及有效群体大小。
- 品种亲缘关系分析:探究威尔士绵羊与欧洲、非洲、亚洲等全球绵羊品种的 ancestry共享模式和遗传距离。
- 农业育种应用:为威尔士绵羊基因组辅助育种策略开发提供遗传结构基础数据。
- 畜牧经济研究:支持威尔士绵羊产业经济价值相关的遗传资源评估与保护研究。