数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了OW939菌株(表达alpha-突触核蛋白::YFP融合蛋白)成年第三天的行为实验数据。实验在荷兰欧洲衰老生物学研究所完成,使用tierpsy软件追踪线虫运动,包含视频处理后的特征数据与行为记录,支持线虫神经行为学研究。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式,共2个)
- 文件名称:55_R_3_OW939_6_Day3_CW_2014_03_21__16_33_02714.hdf5、55_R_3_OW939_6_Day3_CW_2014_03_21__16_33_02714_features.hdf5
- 字段映射介绍:包含线虫运动轨迹的分割骨架数据(共18832个)、行为特征参数(基于tierpsy软件提取)、实验元数据(如帧率31.15帧/秒、像素分辨率4.53微米/像素等)
- 行为数据压缩包(.zip格式,共1个)
- 文件名称:55_R_3_OW939_6_Day3_CW_2014_03_21__16_33_02714.wcon.zip
- 内容说明:存储标准化的线虫行为数据,支持跨平台行为分析工具解析
数据来源
C. elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经行为学研究: 分析alpha-突触核蛋白表达对线虫运动行为的影响,探究神经退行性疾病相关机制
- 行为特征提取方法验证: 基于tierpsy软件输出的特征数据,评估线虫行为追踪算法的准确性
- 衰老相关行为变化研究: 对比不同成年阶段线虫的运动参数,分析衰老对线虫行为的调控规律
- 模式生物实验标准化: 参考实验方案(如30分钟适应期、NGM低蛋白培养基),优化线虫行为实验设计