数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了OW940品系(携带alpha-Synuclein::YFP转基因)成年第20天线虫的运动行为实验数据。实验在荷兰ERIBA实验室开展,通过tierpsy软件追踪线虫在NGM培养基上的运动,包含视频原始数据、特征提取结果等文件,可用于研究衰老相关的线虫行为变化。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:37_R_4_OW940_1_Day20_CCW_2014_05_07__08_07_4481.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫运动的原始追踪数据,记录20758个分段骨架信息,关联worm_id、时间戳等基础实验参数
- 特征提取文件
- 文件名称:37_R_4_OW940_1_Day20_CCW_2014_05_07__08_07_4481_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫运动特征数据,关联实验的帧率(25.974帧/秒)、像素分辨率(4.62556微米/像素)等参数
- 行为数据压缩包
- 文件名称:37_R_4_OW940_1_Day20_CCW_2014_05_07__08_07_4481.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,遵循WCON(Worm Behavior Ontology)标准格式
数据来源
C. elegans behavioural database
适用场景
- 衰老生物学研究:分析成年第20天线虫的运动行为特征,探究衰老对模式生物运动能力的影响
- 神经退行性疾病模型研究:基于alpha-Synuclein转基因线虫,研究帕金森相关蛋白对行为的调控机制
- 行为表型分析:利用tierpsy提取的运动特征,建立线虫行为表型的量化评估体系
- 模式生物实验标准化:参考ERIBA实验室的实验方案,优化线虫行为观测的实验设计与数据采集流程