数据集概述
本数据集为太平洋七鳃鳗（Entosphenus tridentatus）保护应用开发的96个高通量SNP面板相关数据，包含从4439个SNPs中筛选出的最优组合，可用于亲子鉴定、物种鉴定及中性与适应性变异分析。其中9个为FST异常位点，5个位于基因内且与地理、洄游时间及侏儒生活史显著相关，2个可诊断形态难以区分的共生七鳃鳗物种，85个适用于亲子鉴定。数据集含2个文件，支持该濒危物种的保护与恢复研究。
文件详解
- 文件名称：IdentifyLoci_SpeciesDiagnostic.pl
- 文件格式：PL
- 字段映射介绍：物种诊断位点识别脚本，用于筛选可区分太平洋七鳃鳗与其他共生物种的SNP位点。
- 文件名称：EtrMERdryad_96SNPdataset.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含96个SNP面板的数据集，涵盖位点信息、等位基因频率、种群遗传参数等，支持亲子鉴定、物种鉴定及适应性变异分析。
数据来源
论文“Use of genotyping-by-sequencing data to develop a high-throughput and multi-functional SNP panel for conservation applications in Pacific lamprey”
适用场景
- 濒危物种保护遗传学研究：分析太平洋七鳃鳗种群结构、遗传多样性及适应性变异，支持保护策略制定。
- 物种鉴定应用：利用诊断性SNP区分早期幼体阶段形态相似的共生七鳃鳗物种。
- 亲子鉴定与繁殖策略分析：通过高信息度SNP开展亲本分析，揭示种群繁殖模式。
- 适应性进化研究：基于FST异常位点探索地理、洄游时间及生活史相关的适应性遗传机制。
