数据集概述
本数据集包含墨西哥太平洋鳟鱼(Oncorhynchus属)的遗传结构研究数据,涵盖微卫星和单核苷酸多态性(SNP)位点的基因型数据及样本元数据,用于分析其遗传多样性、种群结构及非本地虹鳟鱼的基因渗入情况,为该物种的保护策略提供科学依据。
文件详解
- README_for_DA_genotypes.txt
- 文件格式:TXT
- 内容介绍:数据集说明文档,包含原始数据(DA_genotypes.txt)和元数据(DA_metadata.xlsx)的描述,解释基因型数据来源(微卫星和SNP位点)及元数据字段含义。
- DA_metadata.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含样本元数据,主要字段有ID(个体识别码)、ESU(进化显著单元)、DPS(独特种群片段)等。
- DA_genotypes.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含样本基因型数据,字段包括id(样本ID)、OmyAldA等微卫星位点、SexID(性别ID)、SH95489-423等SNP位点。
数据来源
论文“Genetic structure of Pacific trout at the extreme southern end of their native range”
适用场景
- 遗传多样性分析: 研究墨西哥太平洋鳟鱼的遗传结构、种群分化及进化显著单元划分。
- 生物多样性保护: 评估非本地虹鳟鱼基因渗入程度,指导本土鳟鱼种群保护策略制定。
- 种群遗传学研究: 分析微卫星和SNP位点数据,探究鳟鱼种群的遗传完整性与演化关系。
- 保护生物学应用: 为濒危鳟鱼种群的保护优先级划分及栖息地管理提供数据支持。