数据集概述
本数据集为帕金森病患者队列皮肤穿刺活检的蛋白质组学分析结果,通过质谱技术生成人类皮肤蛋白质组谱库,包含22份3mm皮肤组织样本的DIA-MS分析数据,支持帕金森病皮肤蛋白质组学的进一步研究。
文件详解
- 数据文件(TSV格式):
- report.stats.tsv:统计报告文件,包含前体鉴定数、蛋白质鉴定数等核心统计指标
- report.pr_matrix.tsv:蛋白质组矩阵文件,包含Protein.Group、Protein.Ids、Genes等蛋白质组数据字段
- Skin_pilot_speclib.tsv:皮肤试点研究谱库文件,存储人类皮肤蛋白质组谱库数据
- report.pg_matrix.tsv:蛋白质组学矩阵文件,包含蛋白质组学分析的定量数据
- 日志文件(TXT格式):
- report.log.txt:分析日志文件,记录DIA-NN分析过程的运行信息
- 报告文件(PDF格式):
- report.pdf:分析报告文件,包含蛋白质组学分析的详细结果与说明
数据来源
Michael J. Fox Foundation、Parkinson’s Progression Marker Initiative (PPMI)
适用场景
- 帕金森病蛋白质组学研究:分析患者皮肤组织的蛋白质表达特征
- 生物标志物筛选:探索帕金森病潜在的皮肤蛋白质生物标志物
- 质谱数据分析方法验证:用于DIA-MS蛋白质组学分析流程的验证研究
- 神经退行性疾病机制研究:辅助理解帕金森病的分子病理机制