数据集概述
本数据集为古蛋白质组学解析树懒系统发育的研究数据，包含胶原蛋白序列信息及线粒体DNA证据的整合分析文件，用于探究现生树懒（Choloepus和Bradypus）与灭绝亲属的系统发育关系，修正形态学分类的偏差，涉及系统发育分析的输入数据、配置文件及结果文件共7份。
文件详解
- 系统发育分析输入数据文件
- 文件名称：
protein_data_MrBayes.nex、protein_mtDNA_morphology_sloths_MRB.nex、combined_data_MrBayes.nex
- 文件格式：.nex
- 字段映射介绍：包含蛋白质序列、线粒体DNA序列及形态学数据的整合矩阵，用于MrBayes软件的系统发育分析
- 系统发育分析结果文件
- 文件名称：
combined_protein_mtDNA_xenarthra_bradypus_constraint_beast.tre、protein_only_xenarthra_beast.tre
- 文件格式：.tre
- 字段映射介绍：BEAST软件分析得到的系统发育树，包含节点支持度、分歧时间等信息
- 分析配置文件
- 文件名称：
BEAST_combined_data_bradypus_constraint.xml、BEAST_protein_Xenarthra.xml
- 文件格式：.xml
- 字段映射介绍：BEAST软件的运行参数配置文件，包含模型设置、先验分布、MCMC链参数等
数据来源
论文“Palaeoproteomics resolves sloth phylogeny”
适用场景
- 树懒系统发育研究：用于分析现生及灭绝树懒的亲缘关系，验证古蛋白质组学在系统发育解析中的应用价值
- 生物信息学方法验证：对比不同数据组合（蛋白质单数据、蛋白质+线粒体DNA+形态学数据）的系统发育分析结果差异
- 进化生物学研究：基于分歧时间估计探究树懒类群的演化历程与地理分布关联
- 古蛋白质组学应用拓展：为古生物蛋白质序列在系统发育研究中的应用提供方法参考
