数据集概述
本数据集记录了Ponto-Caspian区域广布甲壳动物Paramysis lacustris的遗传多样性研究数据,包含微卫星和mtDNA标记分析结果,揭示了黑海、亚速海和里海流域间及流域内的深层遗传分化,为该物种的迁徙隔离历史、避难所生存策略及潜在新物种识别提供支持。
文件详解
- 文件名称:Placustris_StructureInput.txt,格式:TXT
- 字段映射介绍:包含遗传结构分析输入数据,预览内容显示样本编号(如PL050KOT)、群体分组及多组基因位点数据(如73 75、226 242等)
- 文件名称:Placutris_MsatGenotypesAndCOInumbers.xlsx,格式:XLSX
- 字段映射介绍:整合微卫星基因型数据与COI基因编号信息的表格文件
- 文件名称:lacustris_IMa2inputs.zip,格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含IMa2软件分析所需的输入数据压缩包
- 文件名称:Placustris_MrBayesinput.nex,格式:NEX
- 字段映射介绍:MrBayes系统发育分析软件的输入文件
- 文件名称:lacustris_PCoAinput.xlsx,格式:XLSX
- 字段映射介绍:主坐标分析(PCoA)所需的输入数据表格
- 文件名称:Placustris_AllCOIsequences.fas,格式:FAS
- 字段映射介绍:包含所有样本的COI基因序列数据文件
数据来源
论文“Migration and isolation during the turbulent Ponto-Caspian Pleistocene create high diversity in the crustacean Paramysis lacustris”
适用场景
- 生物地理学研究:分析Ponto-Caspian区域甲壳动物的遗传分化与地理隔离关系
- 物种进化分析:探究Paramysis lacustris的避难所生存策略及物种形成机制
- 遗传多样性评估:利用微卫星和mtDNA标记数据评估种群遗传结构与多样性水平
- 入侵物种溯源:为Ponto-Caspian区域入侵物种的来源分析提供遗传标记参考
- 生态环境演变研究:通过遗传数据反演Pleistocene时期Ponto-Caspian区域的环境变化对生物的影响