数据集概述
本数据集为濒危鸟类Pale-headed Brushfinch基因多样性研究数据，包含11个中性微卫星位点及5个TLR免疫系统基因适应性SNP变异数据，对比了该物种与两种共存近缘物种的遗传多样性，分析种群瓶颈效应下适应性与中性位点的遗传变化差异，共含8个文件。
文件详解
- 基因序列文件（.fas格式，共5个）
- 文件名称：T1A_Toll like receptor sequences_allspecies.fas、T1B_Toll like receptor sequences_allspecies.fas、T4_Toll like receptor sequences_allspecies.fas、T5_Toll like receptor sequences_allspecies.fas、T21_Toll like receptor sequences_allspecies.fas
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：存储Pale-headed Brushfinch及共存近缘物种的Toll样受体（TLR）基因序列数据，用于分析适应性基因位点的遗传变异
- 基因型数据文件
- 文件名称：MSAT MASTERFILE genotypes Apallidiceps Alatinuchus Btorquatus.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含Pale-headed Brushfinch、Atlapetes latinuchus、Buarremon torquatus三种鸟类的微卫星基因型数据，用于中性位点遗传多样性分析
- 分析代码文件
- 文件名称：MSvar evaluation Rcode.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：用于MSVar分析的R代码文件，支持种群遗传结构与瓶颈效应的统计分析
- 输入数据文件
- 文件名称：hpars_output_input_MSVar evaluation R.dat
- 文件格式：DAT
- 字段映射介绍：MSVar分析的输入数据文件，存储用于种群遗传参数计算的原始数据
数据来源
论文“Genetic depletion at adaptive but not neutral loci in an endangered bird species”
适用场景
- 濒危物种遗传多样性评估：分析Pale-headed Brushfinch适应性与中性基因位点的遗传变化，评估种群瓶颈效应影响
- 生物保护策略制定：基于适应性基因位点遗传损耗情况，为濒危鸟类制定针对性保护管理计划
- 进化遗传学研究：对比不同物种TLR免疫系统基因序列，探究适应性基因的进化规律
- 种群遗传学分析：利用微卫星基因型数据，研究濒危物种与近缘物种的种群遗传结构差异
