Panicum属分子系统发育与生物地理学及进化研究数据集

数据集概述

本数据集围绕Panicum属(狭义)的分子系统发育展开,结合ndhF质体区域序列数据,通过广泛采样分析其进化关系、分类边界、分化时间、生物地理历史及生活史(一年生/多年生)进化模式,为该属系统分类和进化研究提供支撑。

文件详解

该数据集包含多种格式的文件,具体说明如下: - 系统发育树文件(.tre格式):共5个文件,如Panicinae_CAL1_MCCT_BEAST.tre、Panicinae(BEAST)CAL1_1000trees.tre等,记录不同分析方法(BEAST、RAxML)生成的系统发育树结果。 - 图表文件(.pdf格式):共3个文件,如FIGS1.pdf、FIGS2.pdf、FigS3.pdf,包含研究中的关键图表。 - 表格文件(.docx格式):共2个文件,Table S1.docx、TableS2.docx,记录研究相关的补充表格数据。 - XML配置文件(.xml格式):共2个文件,Panicinae(BEAST)CAL1.xml、Panicinae(BEAST)CAL2.xml,为BEAST分析的配置文件。 - 序列比对文件(.fas格式):Panicinae_ndhF_alignment.fas,为ndhF质体区域的序列比对数据。

适用场景

  • 植物系统分类学研究:用于验证Panicum属的单系性、修订属的界定及属下分类系统。
  • 进化生物学研究:分析Panicum属及相关类群的分化时间、生物地理历史及生活史性状(一年生/多年生)的进化模式。
  • 生物地理学研究:探讨Panicum属的洲际扩散路径及历史生物地理过程。
  • 分子系统发育方法学应用:作为案例数据,用于测试和比较不同系统发育分析方法(如BEAST、RAxML)的效果。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 6.01 MiB
最后更新 2025年12月22日
创建于 2025年12月22日
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