数据集概述
本数据集包含Paudel et al. 2019相关的生物学数据,涉及基因、统计相关性及数据转换等内容,以CSV格式存储,涵盖基因表达差异、代谢物变化、量化速率等多类生物学与统计分析数据。
文件详解
该数据集包含11个CSV格式文件,均位于"New folder/"目录下,具体如下:
- 基因表达分析文件:
- results_edgeR_baseline_ANOVA.csv:含logFC(组间表达差异对数倍)、logCPM(表达量对数)、PValue(P值)、symbol(基因符号)等字段
- 代谢物数据文件:
- redox_molecules_name.csv:可能为氧化还原分子名称列表
- redox_fc_wm88_plx_vs_dmso.csv:含dmso(对照组值)、plx(处理组值)、fc(倍数变化)、lfc(对数倍数变化)、pvalue(P值)、fdr(校正后P值)等字段
- redox_fc_sc10_plx_vs_dmso.csv:结构同上述氧化还原倍数变化文件
- 功能注释与通量分析文件:
- GO_Terms_CCLE_Subclones.csv:可能为细胞系亚克隆的GO功能注释数据
- sc01_sc10_fva.csv:可能为代谢通量分析结果数据
- ALL_Metaboanalyst_set2_all.csv:可能为代谢组学分析数据集
- 量化速率文件:
- Quantified_DIP_rates_CCLE_Melanoma.csv:含CCLE黑色素瘤细胞系的量化DIP速率数据
适用场景
- 生物学研究:分析基因表达差异、代谢物变化与氧化还原状态的关联
- 统计分析:探究生物学指标间的相关性及组间差异显著性
- 数据处理方法验证:基于转换后的数据验证生物学数据处理流程
- 细胞系实验分析:研究药物处理对细胞系基因表达及代谢的影响