数据集概述
本数据集围绕爬行动物胎生进化研究，分析祖先状态重建中忽略进化速率异质性导致的异常结果，对比三种速率可变方法（随机局部时钟法、拆分BiSSE、隐藏速率模型）的重建效果，结合蜥蜴类爬行动物胎生进化实证分析及模拟验证传统模型不足。
文件详解
- 图表文件：
- Fig1_Expanded.pdf：PDF格式，扩展版图1
- Fig2_Expanded.pdf：PDF格式，扩展版图2
- Figures_S1-S6.docx：DOCX格式，包含补充图S1至S6
- S5_SimulationResults.pdf：PDF格式，模拟结果文件
- 文档文件：
- S2_BEAST_RLCsettings.docx：DOCX格式，BEAST随机局部时钟设置说明
- Tables_S1-S8.docx：DOCX格式，包含补充表S1至S8
- 代码文件：
- S4_Simulations_RCode.r：R格式，模拟分析代码
- 数据与配置文件：
- S1_BEAST_executable.xml：XML格式，BEAST可执行配置文件
- S3_BEAST_figtree.tree：TREE格式，BEAST生成的系统发育树文件
适用场景
- 进化生物学研究：分析爬行动物胎生进化的祖先状态重建
- 系统发育方法验证：评估速率异质性对离散性状祖先状态重建的影响
- 生物信息学方法应用：测试BEAST随机局部时钟法等速率可变模型的效果
- 爬行动物进化分析：研究蜥蜴类爬行动物胎生性状的进化模式
- 计算进化模拟：验证传统模型在性状不对称与异速进化场景下的局限性
