数据集概述
本数据集来自鲈科(Percidae)鱼类体型进化与物种形成研究,包含8个文件,涉及系统发育树、基因库数据、体型数据及分析文件。数据支持研究鲈科鱼类体型进化速率、适应性最优体型及物种形成速率与体型的关系,揭示小型鱼类进化特征,为宏观进化研究提供基础数据。
文件详解
- 系统发育树文件(.trees格式,共4个)
- 文件名称:percidae_constrained_-combined_posterior_distribution.trees、percidae_unconstrained_mcc_chronogram.trees、percidae_constrained_mcc_chronogram.trees、percidae_unconstrained-_combined_posterior_distribution.trees
- 文件格式:TREES
- 字段映射介绍:包含鲈科鱼类基于约束与非约束模型构建的时间校准系统发育树,记录物种间进化关系、分歧时间及后验分布信息。
- 基因库与体型数据文件(.xlsx格式,共2个)
- 文件名称:percidae_genbank_data.xlsx、body_size_data_source.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:percidae_genbank_data.xlsx记录鲈科鱼类多基因位点的基因库数据;body_size_data_source.xlsx包含物种最大体型数据及来源信息。
- 分析配置文件(.xml格式,共2个)
- 文件名称:percidae_unconstrained_200_million.xml、percidae_constrained_200_million.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:记录体型进化分析的模型配置参数,包括约束与非约束模型的2亿年时间校准设置。
数据来源
论文“The little fishes that could: smaller fishes demonstrate slow body size evolution but faster speciation in the family Percidae”
适用场景
- 进化生物学研究: 分析鲈科鱼类体型进化速率、适应性最优体型及物种形成速率与体型的关联。
- 宏观生态学分析: 探究生物体型分布的宏观生态与进化驱动因素。
- 系统发育树构建: 利用多基因位点数据构建鲈科鱼类时间校准系统发育树。
- 生物多样性研究: 揭示小型鱼类高物种多样性的进化机制。