数据集概述
本数据集是论文《猪舍中对最高优先级关键重要氟喹诺酮类或第三代、第四代头孢菌素类抗生素耐药的大肠杆菌持续存在》的补充材料，包含11个文件，涉及猪场管理数据、细菌耐药性统计、抗生素使用情况及相关图表，用于支撑猪舍耐药大肠杆菌的研究结论。
文件详解
- 图片文件（.tiff格式，共5个）
- 02_Pfeifer_FigS1_Heatmap_structure.tiff：热图结构图片，展示数据关联的可视化结构
- 03_Pfeifer_FigS2_Fraction_resistant_bacteria_per_age.tiff：不同日龄耐药细菌比例图
- 06_Pfeifer_FigS3_Percentage_resistent-bacteria_Farms_O2_and_C1.tiff：O2和C1农场耐药细菌百分比图
- 07_Pfeifer_FigS4_MLVA_PCR_gel.tiff：MLVA PCR凝胶电泳图
- 08_Pfeifer_FigS5_Antibiotic_usage.tiff：抗生素使用情况图
- 表格文件（.csv格式，共5个）
- 00_Pfeifer_Cephalosporin_resistence_persists_in_pigs.csv：头孢菌素耐药性持续存在相关数据
- 04_Pfeifer_TabS2_cfu_all_farms.csv：所有农场的菌落形成单位（cfu）数据，包含Sample（样本）、Farm（农场）、Age（日龄）、GA/GE/GF/GQ（不同抗生素耐药菌数量）等字段
- 05_Pfeifer_TabS3_Stats_Figure2_Wilcoxon.csv：Wilcoxon统计检验数据，包含GroupA、GroupB、p.value字段
- 表格文件（.xlsx格式，共1个）
- 01_Pfeifer_TabS1_Farm_management_data.xlsx：农场管理数据表格
数据来源
论文“Escherichia coli resistant to the highest priority critically important fluoroquinolone or 3rd and 4th generation cephalosporin antibiotics persist in pigsties”
适用场景
- 兽医微生物耐药性研究：分析猪舍中高优先级抗生素耐药大肠杆菌的分布特征与持续机制
- 猪场抗生素使用评估：结合抗生素使用数据与耐药性结果，评估用药对细菌耐药性的影响
- 耐药性统计分析：利用Wilcoxon检验数据验证不同农场、不同日龄猪群的耐药性差异
- 动物源耐药菌传播风险评估：为研究猪舍耐药大肠杆菌向环境或人类传播的潜在风险提供数据支撑
- 农场管理与耐药性关联分析：通过农场管理数据与耐药性数据的交叉分析，探索管理措施对耐药性控制的作用
