PGBD5_Based人类转座酶基因组重排正向遗传筛选实验数据

数据集概述

本数据集来自人类转座酶基因组重排的正向遗传筛选研究,通过HPRT1筛选结合高通量测序技术,分析人类转座酶PGBD5诱导的HPRT1突变谱及潜在基因组重排底物(PSS基序),为解析PGBD5等驯化转座酶的内源性基因组重塑活性提供支持,包含五份文件。

文件详解

  • Metadata_HPRT1.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含HPRT1筛选实验的元数据信息
  • HPRT_laSV_SV_files.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:包含HPRT1相关的laSV结构变异文件压缩包
  • PWM_PSS_and_RSS.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含PSS基序和RSS序列的位置权重矩阵(PWM)数据
  • HPRT_CRISPResso_files.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:包含HPRT1实验的CRISPResso分析结果文件压缩包
  • Analysis_breakpoints_laSV.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含laSV结构变异断点的分析数据

适用场景

  • 人类转座酶功能研究: 分析PGBD5诱导的HPRT1突变谱,解析其基因组重排活性及机制
  • 基因组重排底物识别: 基于PSS基序数据,鉴定潜在的PGBD5基因组重排靶序列
  • 正向遗传筛选方法优化: 参考HPRT1筛选与高通量测序结合的技术流程,优化转座酶活性分析方法
  • 驯化转座酶研究: 为解析其他人类驯化DNA转座酶/重组酶的内源性基因组重塑功能提供数据支持
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 305.88 MiB
最后更新 2026年1月29日
创建于 2026年1月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。