数据集概述
本数据集记录英国草地公园实验(PGE)中野生草Anthoxanthum odoratum的土壤铝耐受基因变异及局部适应研究数据,涵盖幼苗与成株表型、基因型、SNP侧翼序列等信息,用于分析植物对土壤酸化的快速进化机制,包含5个相关文件。
文件详解
- 文件名称:Tiller_phenotypes.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含PLANT_ID(植株ID)、SUBPLOT(子样地)、TREATMENT(处理)、DATASET(数据集)、TUBPAIR(管对)、L1-L3(长度指标)、P1-P2(表型指标)、RRG (CM)(相对根生长)等成株表型数据
- 文件名称:Seedling_phenotypes.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录幼苗阶段的表型数据(具体字段未明确,推测含幼苗生长、铝耐受相关指标)
- 文件名称:Genotypes.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含植物基因型数据,用于分析与铝耐受相关的基因变异
- 文件名称:Snp_flanks.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录与铝耐受相关的单核苷酸多态性(SNP)侧翼序列信息
- 文件名称:Polyploid-0.3.2_Public.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩文件,推测包含多倍体分析相关的公开数据或工具
数据来源
论文“Variation in soil aluminum tolerance genes is associated with local adaptation to soils at the Park Grass Experiment”
适用场景
- 植物进化研究:分析野生草Anthoxanthum odoratum对土壤铝毒性的局部适应机制及快速进化过程
- 土壤适应基因分析:研究ALMT、TIP、STAR1等基因变异与土壤酸度的关联
- 表型-基因型关联研究:通过幼苗与成株表型数据,探究铝耐受性状与基因变异的对应关系
- 环境变化响应研究:验证遗传变异对植物适应土壤酸化等快速环境变化的贡献