PhenoSelect藻类表型原始数据集

数据集概述

本数据集包含通过PhenoSelect系统采集的五种藻类在九十六种实验条件下的表型原始数据,以及用于计算表型组大小和Bootstrap统计比较的Python代码。核心数据为光合效率、生长速率、细胞大小等每日测量值,支持跨物种表型分析与不确定性评估。

文件详解

  • 原始测量数据文件(.xlsx格式,共五个文件):
  • 分别对应五种藻类五天后的表型数据,如《Traits of Chlorella sorokiniana after 5 days.xlsx》,包含光合效率(Fv/Fm)、生长速率、细胞大小(或生物量)等原始测量字段
  • 表型组大小计算数据文件:
  • Phenome size calculation data file RAW trait values.csv:CSV格式,存储原始尺度的表型特征值
  • Phenome size calculation data file NORMALISED trait values.csv:CSV格式,存储经归一化处理的表型特征值,用于跨物种比较
  • 分析代码文件:
  • Jupyter Notebook for Phenome size calculation.ipynb:Jupyter笔记本格式,包含计算三维凸包体积及一万次Bootstrap迭代评估不确定性的Python代码

适用场景

  • 藻类生理学研究:分析不同实验条件下藻类光合效率、生长速率等表型特征的变化规律
  • 表型组学分析:基于三维凸包体积计算多物种表型组大小,开展跨物种表型比较
  • 统计方法应用:利用Bootstrap方法评估表型数据的不确定性,验证实验结果的可靠性
  • 算法复现:基于提供的Python代码复现相关研究中的表型组大小计算流程
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.31 MiB
最后更新 2025年11月29日
创建于 2025年11月29日
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