数据集概述
本数据集为菲律宾森林龙(Agamidae科:Gonocephalus属)群岛范围调查的多基因座系统发育数据,包含7个相关文件,用于揭示该生物多样性热点地区前所未有的遗传多样性,支持物种界定统计和系统发育推断研究。
文件详解
- 系统发育分析文件(XML格式,共5个)
- 文件名称:StarBEAST_Yule_nuclear.xml、StarBEAST_Yule_2partitions.xml、StarBEAST_BD_nuclear.xml、StarBEAST_BD_2partitions.xml、BEAST_7gene.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:包含系统发育分析的参数设置、模型配置及数据引用信息,用于BEAST/StarBEAST软件的物种树推断
- 基因序列数据文件(NEX格式,共2个)
- 文件名称:Gono_7gene.phased.nex、Gono_7gene.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:包含7个基因座的序列数据,其中Gono_7gene.phased.nex为相位化处理后的基因序列,Gono_7gene.nex为原始基因序列集合
数据来源
论文“Archipelago-wide survey of Philippine forest dragons (Agamidae: Gonocephalus): multilocus phylogeny uncovers unprecedented levels of genetic diversity in a biodiversity hotspot”
适用场景
- 生物多样性研究:分析菲律宾森林龙的遗传多样性及地理分布模式
- 系统发育分析:利用多基因座数据推断Gonocephalus属的物种演化关系
- 物种界定研究:结合溯祖模型统计方法评估菲律宾森林龙的潜在物种多样性
- 生物地理学分析:探究岛屿辐射演化中地理隔离对遗传分化的影响机制
- 保护生物学应用:为生物多样性热点地区的森林龙物种保护提供遗传数据支持