Phoenix_dactylifera_Based_椰枣品种NaCl胁迫转录组响应补充表格数据

数据集概述

本数据集为椰枣品种转录组响应研究的补充表格，包含Khalas和Sultana两个椰枣品种在NaCl胁迫下的转录组分析数据。实验通过盆栽培养椰枣幼苗，设置非盐胁迫和盐胁迫处理，采集根和茎组织进行RNA测序及生物信息分析，以探究其耐盐分子机制。

文件详解

• 文件名称：Palms_Pongrac_Fischer_White et al_suppl_RNAseq_tables.xlsx
• 文件格式：XLSX
• 字段映射介绍：包含补充表格Table S4-12，内容涉及转录组测序原始数据过滤结果、参考基因组比对信息、新基因及新转录本鉴定统计、基因表达量（TPM值）、差异表达基因（DEGs）筛选结果（含折叠变化、调整后p值等指标）。

适用场景

• 植物耐盐分子机制研究: 分析椰枣品种在NaCl胁迫下的差异表达基因，探究耐盐相关信号通路及关键基因功能。
• 作物抗逆性遗传育种: 筛选椰枣耐盐候选基因，为耐盐品种分子育种提供靶点。
• 转录组数据分析方法验证: 参考RNA测序数据处理流程（如SOAPnuke过滤、HISAT2比对、DESeq2差异分析）及参数设置。
• 农业生态适应性评估: 评估椰枣品种对盐胁迫的生理响应差异，为盐碱地农业种植提供数据支持。