数据集概述
本数据集记录了磷饥饿条件下杨树(Populus × canescens)叶片和根系的转录组变化及营养元素浓度响应。包含超4000个根系差异表达基因和超9000个叶片差异表达基因,这些基因聚类为11个共表达模块,其中7个与植物组织中的特定元素相关。数据集通过加权基因共表达网络分析揭示了磷饥饿响应的层级结构,总计包含6个文件。
文件详解
- README文档
- 文件名称:README_for_Table4_Gene_Transcript_abundance.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:提供Table4基因转录本丰度数据的说明文档
- README文档
- 文件名称:README_for_Table1_Biomass.xlsx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:提供Table1生物量数据的说明文档
- 元素浓度数据
- 文件名称:Table2_Elements_by_ICP.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含叶片和根系中各营养元素(P、S、K、Mg、Ca、N、Zn、Al、C、Fe、Mn等)的浓度数据
- 基因转录本丰度数据
- 文件名称:Table4_Gene_Transcript_abundance.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含磷饥饿条件下差异表达基因的转录本丰度数据
- 碳氮数据
- 文件名称:Table3_C_N.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含叶片和根系中的碳(C)和氮(N)元素浓度数据
- 生物量数据
- 文件名称:Table1_Biomass.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含磷饥饿条件下杨树叶片和根系的生物量数据
数据来源
论文“Dissecting nutrient-related co-expression networks in phosphate starved poplars”
适用场景
- 植物营养学研究: 分析磷饥饿条件下杨树对不同营养元素(P、S、K、Mg、Ca、N、Zn、Al等)的响应机制
- 转录组学分析: 研究磷饥饿条件下杨树根系和叶片的差异表达基因及其功能分类
- 基因共表达网络分析: 探索磷饥饿响应相关基因的共表达模块及其与营养元素的关联
- 植物磷饥饿适应机制研究: 揭示磷饥饿条件下杨树的代谢调整、信号传导及防御反应机制
- 生物量与营养元素关系研究: 分析磷饥饿对杨树生物量及碳氮元素分配的影响