数据集概述
本数据集包含双线斜纹夜蛾（桑尺蠖）参考转录组分析生成的原始读数计数和FPKM值，涵盖所有实验条件的样本ID信息。样本包括暴露于有机磷类、线粒体抑制剂类杀虫剂处理及对照组的幼虫，每个样本配有处理条件、生物学重复等元数据，可用于基因表达差异等生物信息学分析。
文件详解
- 注释文件
- 文件名称：emapper.annotations.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含基因注释信息（具体字段未提供，推测为基因功能、同源基因等注释内容）
- 差异表达结果文件（共5个）
- 文件名称：read_count.Control_vs_Trichlorfon.edgeR.DE_results.txt、read_count.Control_vs_Tolfenpyrad.edgeR.DE_results.txt、read_count.Control_vs_Phoxim.edgeR.DE_results.txt、read_count.Control_vs_Trichlorfon_Malathion.edgeR.DE_results.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：edgeR分析得到的对照组与不同杀虫剂处理组的差异表达基因结果（具体字段未提供，推测包含基因ID、差异倍数、显著性P值等）
- FPKM值文件
- 文件名称：all_samples_fpkm.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：所有样本的基因FPKM值（基因表达量标准化数据）
- 原始读数计数文件
- 文件名称：all_samples_counts.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含Geneid（基因ID）及各样本（如CM1-CM3、CX1-CX3等）的原始读数计数
- 样本分组文件
- 文件名称：all_samples_group.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：记录所有样本的分组信息（对应不同处理条件）
- 合并的差异倍数文件
- 文件名称：merged_log2fc.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：合并后的基因对数2差异表达倍数数据
适用场景
- 昆虫毒理学研究: 分析双线斜纹夜蛾对不同杀虫剂处理的基因表达响应
- 抗药性机制分析: 挖掘与有机磷类、线粒体抑制剂类杀虫剂抗性相关的关键基因
- 差异基因表达分析: 基于原始读数计数和FPKM值开展对照组与处理组的差异表达研究
- 通路富集分析: 结合注释文件和差异表达结果，探究杀虫剂处理影响的生物学通路
- 机器学习应用: 利用基因表达数据构建昆虫毒理学相关的机器学习模型
