数据集概述
本数据集围绕Arabidopsis lyrata ssp. petraea北欧Spiterstulen种群PHYA基因座的局部选择清除展开，包含德国Plech与挪威Spiterstulen种群PHYA及周边区域重测序数据，以及与19个基因组参考位点的分化和多样性对比结果，用于探究PHYA在该物种适应北方气候中的作用。
文件详解
- 说明文档类（.txt）
- 文件名称：README_for_Alignment_files.txt、README_for_LD_across 57 kb region.txt、README_for_LD_2 and 9_loci.txt、README_for_ssw_clsw.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：分别对应比对文件、57kb区域连锁不平衡（LD）、2个和9个位点LD、ssw/clsw程序相关的说明，含实验方法、数据参数等背景信息
- 压缩文件类（.zip）
- 文件名称：Alignment_files.zip、ssw_clsw.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：Alignment_files.zip包含序列比对数据；ssw_clsw.zip包含与选择清除分析程序相关的数据
- 序列文件类（.fas）
- 文件名称：LD_across 57 kb region.fas、LD_2 and 9_loci.fas
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：分别为57kb区域、2个和9个位点的连锁不平衡分析序列数据
- 表格文件类（.xlsx）
- 文件名称：Fragment and sample specific Accession nos.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含片段及样本对应的登录号信息
适用场景
- 植物适应性进化研究：分析PHYA基因座在Arabidopsis lyrata适应北欧气候中的选择信号
- 群体遗传学分析：对比不同种群间PHYA及参考位点的遗传分化与多样性模式
- 连锁不平衡研究：探究Spiterstulen种群PHYA区域的连锁不平衡特征及其与选择清除的关系
- 基因功能验证：结合PHYA对光周期的感知功能，验证其对植物生活史性状的调控作用
- 进化时间推断：基于选择清除信号推测PHYA适应性进化发生的时间节点
