数据集概述
本数据集为伊比利亚特有蛙类R. parvipalmata的系统地理学多样性研究数据,包含三类核心内容:细胞色素b(cyt-b)序列比对及元数据、RAD-seq序列比对与SNP矩阵及元数据、R. parvipalmata及近缘种R. temporaria的形态测量原始数据及元数据,覆盖分子遗传与形态学维度,支持物种系统地理学分析,总计6个文件。
文件详解
- 分子序列与元数据文件
- 文件名称:Rana_parvipalmata_cytb_metadata.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含R. parvipalmata样本的来源、分类学归属及谱系身份等元数据
- 文件名称:Rana_parvipalmata_cytb_sequences.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:R. parvipalmata的细胞色素b(cyt-b)基因序列比对数据
- 文件名称:Rana_parvipalmata_RAD_metadata.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含R. parvipalmata样本的来源、分类学归属及谱系身份等元数据
- 文件名称:Rana_parvipalmata_RAD_sequences.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:R. parvipalmata的RAD-seq序列比对数据
- 文件名称:Rana_parvipalmata_RAD_SNPs.str
- 文件格式:STR
- 字段映射介绍:R. parvipalmata的SNP矩阵数据(structure格式)
- 形态测量数据文件
- 文件名称:Rana_morphometric_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含R. parvipalmata及R. temporaria样本的体长(SVL)、18项生物测量特征,以及样本来源、分类学归属和谱系身份等元数据
数据来源
论文“Delimiting phylogeographic diversity in the genomic era: application to an Iberian endemic frog”
适用场景
- 物种系统地理学研究:分析伊比利亚特有蛙类R. parvipalmata的谱系分化与地理分布格局
- 分子遗传多样性分析:利用cyt-b和RAD-seq数据评估种群遗传结构与基因流
- 形态学特征比较研究:通过形态测量数据对比R. parvipalmata与近缘种的形态差异
- 基因组学物种界定:结合分子与形态数据,探索基因组时代物种界定的方法与标准