数据集概述
本数据集为可直接加载的phyloseq R S4对象，包含牛初乳样本的ASV表、分类表及样本元数据（基于16S V3-V4区域测序）。数据通过DaDa2和phyloseq R包构建，原始测序数据存储于NCBI-SRA的BioProject PRJNA872909，用于研究不同储存方法对牛初乳总细菌计数及微生物组成的影响。
文件详解
- RobbersBossers2022_Colostrum.metadata.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含牛初乳样本的元数据信息，涉及储存方法、储存时间、温度等实验条件及样本基本属性
- RobbersBossers2022_Colostrum.phyloseq.RDS
- 文件格式：RDS
- 字段映射介绍：phyloseq R S4对象，整合了ASV表（物种丰度数据）、分类表（物种分类信息）和样本元数据，支持直接用于R语言的微生物群落分析
数据来源
NCBI-SRA BioProject: PRJNA872909
适用场景
- 牛初乳微生物群落研究: 分析不同储存条件下牛初乳中细菌群落的结构变化及优势物种组成
- 储存方法优化: 评估室温、冷藏等不同储存方式对牛初乳总细菌计数及微生物多样性的影响
- 被动免疫研究支撑: 为新生儿犊牛通过初乳获取被动免疫的相关研究提供微生物学数据参考
- 农业生产应用: 指导牧场牛初乳储存管理实践，提升初乳品质控制水平
- 微生物测序数据分析方法验证: 作为phyloseq和DaDa2分析流程的实例数据，用于方法学验证和教学演示
