数据集概述
本数据集围绕Physalis属(茄科)植物的防御进化展开,通过系统发育比较方法分析生长速率、生活史(一年生/多年生)、交配系统(自交亲和/不亲和)对组成型抗性和诱导型抗性的影响,验证防御策略的进化约束及权衡关系,包含22个相关文件。
文件详解
- 数据文件(.csv):共6个,包括pglsout_se_ind.csv(诱导型抗性模型标准误)、pglsout_coef_ind.csv(诱导型抗性模型系数)、physalis_datasheet.csv(样本数据表)、Fig1.csv(图表1数据)等,记录模型输出系数、标准误及原始样本数据
- 代码文件(.r):共7个,包括phylosig_consensus.R(系统发育信号分析代码)、pgls_multi_const.R(组成型抗性多变量系统发育广义最小二乘分析代码)等,用于执行系统发育比较分析
- 文档文件(.docx):共2个,包括README.docx(数据集说明文档)、GenBank physalis sequences.docx(GenBank序列文档),提供数据集背景及序列信息
- 文本文件(.txt):共4个,包括pgls_consensus_const_PphiA.txt(组成型抗性模型拟合代码)等,记录模型拟合的代码片段
- 其他文件(.nexus):共3个,包括physalis2.nexus、run1.nexus等,为系统发育分析用的Nexus格式文件
适用场景
- 植物防御进化研究:分析生长速率、生活史对组成型与诱导型抗性的影响,验证防御策略的进化权衡
- 系统发育比较方法应用:利用代码文件复现Physalis属植物的系统发育广义最小二乘分析过程
- 植物性状关联分析:探究植物生长、繁殖性状与抗性表型的关联模式
- 茄科植物生物学研究:为Physalis属植物的抗性机制及生态适应研究提供数据支持