数据集概述
本数据集为用于MALDI-TOF MS鉴定疫霉属(Phytophthora)物种的自定义主光谱(MSP)库,包含26种疫霉属及1种腐霉属(Pythium)菌株的质谱数据,由捷克植物病原卵菌收藏中心(CCPO)提供菌株,经标准化样本制备、质谱检测及MSP处理流程生成,支持微生物物种的质谱鉴定研究。
文件详解
- 文件名称:
Phytophthora _v1.btmsp
- 文件格式:BTMSP
- 字段映射介绍:疫霉属物种的自定义主光谱库文件,包含经MALDI Biotyper处理生成的标准MSP光谱数据,用于质谱模式匹配鉴定。
- 文件名称:
List of isolates and GenBank identification.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:菌株信息表,包含43株供试菌株的分离株列表及对应的GenBank鉴定信息,关联质谱数据与物种分类学标识。
- 文件名称:
all_spectra_as_made.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩归档文件,包含所有原始质谱检测光谱数据,保留样本测量的原始光谱信息。
数据来源
捷克植物病原卵菌收藏中心(CCPO)
适用场景
- 疫霉属物种快速鉴定: 利用MSP库通过MALDI-TOF MS技术实现植物病原疫霉属物种的快速、准确鉴定。
- 微生物质谱数据库构建: 为微生物质谱鉴定数据库补充疫霉属及相关卵菌的高质量参考光谱。
- 植物病害诊断技术研究: 探索MALDI-TOF MS在植物病原真菌/卵菌鉴定中的应用潜力与优化方向。
- 微生物分类学辅助研究: 结合GenBank鉴定信息,分析质谱数据与物种分类学特征的关联。