PIANO_NAZIONALE_FoodMicrobionet_5_1_1_mindata_食品微生物组研究完整数据

数据集概述

本数据集为FoodMicrobionet v5.1.1版本的mindata文件压缩包,包含可通过NCBI登录号访问单个研究信息的R列表对象,每个对象集成研究信息、样本数据及分类学相关标识,支持微生物组数据分析。

文件详解

  • 文件名称: mindata_FMBN.zip
  • 文件格式: ZIP压缩包
  • 内容结构: 压缩包内包含独立文件夹,分别存储细菌(基于SILVA数据库v138.1、v138.2)和真菌(基于UNITE数据库、SILVA SSU、LSU)数据;每个数据对象为R列表,包含字段:
  • Study_accn: 研究登录号
  • study_df: 研究信息数据框
  • overlap: 重叠配对序列使用标识(逻辑值)
  • pend: 配对序列使用标识(逻辑值)
  • physeq: 含样本、分类群、OTU表及系统发育树(若有)的phyloseq对象
  • rev_compl: 序列反向互补转换标识(用于分类学注释)

数据来源

Ministero dell'Università e della Ricerca PRIN 2022 PNRR、European Union Next-GenerationEU(PIANO NAZIONALE DI RIPRESA E RESILIENZA (PNRR))

适用场景

  • 食品微生物组研究: 分析不同食品样本中的细菌、真菌群落结构
  • 微生物分类学分析: 基于NCBI登录号关联研究数据,开展分类学注释与系统发育分析
  • 生物信息学方法验证: 利用phyloseq对象测试微生物组数据分析流程
  • 发酵食品资源挖掘: 结合资助项目背景,探究非传统酵母等微生物资源的应用价值
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 241.69 MiB
最后更新 2025年12月14日
创建于 2025年12月14日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。