数据集概述
本数据集围绕葡萄牙角鲨（Centroscymnus coelolepis）的种群遗传结构展开研究，通过11个核微卫星标记和线粒体DNA控制区片段，分析直布罗陀海峡对其基因流动的阻隔作用。数据揭示了大西洋种群遗传同质化、地中海种群显著分化的特征，为深海鲨鱼连通性机制研究提供支撑，包含10个相关文件。
文件详解
- 说明文档类（TXT格式）
- 文件名称：README_for_IMa_parameter_file.txt、README_for_CC_CR_aligment_haplotypes.txt、README_for_CC_microsatellites_genotypes.txt、README_for_CC_CR_aligment_all.txt、README_for_CC_DB_biologic_data.txt
- 内容：对应数据文件的参数说明、数据格式及字段解释
- 分析参数文件（TXT格式）
- 文件名称：IMa_parameter_file.txt
- 内容：记录IMa分析的参数设置，包括输入输出文件路径、迭代次数、模型参数等
- 基因型数据文件（TXT格式）
- 文件名称：CC_microsatellites_genotypes.txt
- 内容：503个葡萄牙角鲨样本的11个核微卫星标记基因型数据
- 序列比对文件（FAS格式）
- 文件名称：CC_CR_aligment_all.fas、CC_CR_aligment_haplotypes.fas
- 内容：线粒体DNA控制区全序列比对及单倍型序列比对结果
- 生物学数据文件（XLSX格式）
- 文件名称：CC_DB_biologic_data.xlsx
- 内容：葡萄牙角鲨的生活史特征数据，包括不同区域个体的体型、成熟尺寸等信息
数据来源
论文“The Pillars of Hercules as a bathymetric barrier to gene-flow promoting isolation in a global deep-sea shark (Centroscymnus coelolepis)”
适用场景
- 深海鲨鱼种群遗传学研究：分析不同海域葡萄牙角鲨的遗传结构与分化程度
- 地理屏障对生物连通性影响研究：验证直布罗陀海峡作为基因流动阻隔的作用机制
- 濒危物种保护策略制定：基于地中海种群的独特性，为葡萄牙角鲨保护提供遗传依据
- 海洋生态系统连通性分析：探究深海生态系统中物种基因流动的限制因素
- 种群动态历史重建：通过遗传数据推断葡萄牙角鲨种群的演化历史与隔离时间
