数据集概述
本数据集为斐济黑唇珍珠牡蛎(Pinctada margaritifera)渔业管理研究的配套数据,包含基因组遗传数据与流体动力学模拟结果。通过4123个SNP位点的全基因组数据,结合独立的流体动力学粒子扩散模型,分析该高扩散性海洋无脊椎动物的种群结构、遗传分化及幼体扩散路径,为其渔业管理和保护提供生物学依据。数据集包含2个文件。
文件详解
- 文件名称:README_for_Genotype_file_4123_SNPs.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:基因型数据文件的说明文档,包含数据背景、采样信息、SNP位点筛选方法、基因型数据格式及使用指南等内容,辅助理解基因组数据的来源与分析逻辑。
- 文件名称:Genotype_file_4123_SNPs.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含4123个SNP位点的全基因组基因型数据,记录斐济黑唇珍珠牡蛎野生种群与养殖种群的基因分型信息,支持种群遗传结构、遗传分化(如Fst值)及瓶颈效应等分析。
数据来源
论文“A parallel population genomic and hydrodynamic approach to fishery management of highly-dispersive marine invertebrates: the case of the Fijian black-lip pearl oyster Pinctada margaritifera”
适用场景
- 海洋渔业种群管理: 利用种群遗传结构数据,确定斐济黑唇珍珠牡蛎的生物种群边界,为渔业资源评估和管理单元划分提供依据。
- 海洋无脊椎动物遗传多样性研究: 通过SNP位点分析,评估野生与养殖种群的遗传分化程度及遗传瓶颈效应。
- 海洋生物幼体扩散模拟: 结合流体动力学模型结果,分析幼体扩散路径与种群连通性的关系。
- 高扩散性海洋物种保护策略制定: 基于种群结构与扩散数据,制定针对性的保护措施,保障物种可持续利用。