数据集概述
本数据集包含瑞士石松（Pinus cembra）24个阿尔卑斯种群（480个个体）的外显子组基因组数据及环境变量数据，涉及超过17,000个SNP位点。数据用于研究地理边缘性、栖息地适宜性与中性及适应性遗传变异的关联，分析种群遗传多样性的分布规律及影响因素。
文件详解
- SNP位点数据文件
- 文件名称：Pinus_cembra_All_17061_SNPs_MEC-19-1345.xlsx、Pinus_cembra_All_17061_SNPs_MEC-19-1345.csv
- 文件格式：XLSX、CSV
- 字段映射介绍：包含CHROM（染色体）、POS（位置）及24个种群样本（如CH_005、EC_HJ等）的SNP基因型数据，共覆盖17,061个SNP位点
- 环境变量数据文件
- 文件名称：Pinus_cembra_All_Env_variables_MEC-19-1345.csv、Pinus_cembra_All_Env_variables_MEC-19-1345.xlsx
- 文件格式：CSV、XLSX
- 字段映射介绍：包含Sample_ID（样本编号）、地理坐标（Average_Lat纬度、Average_Long经度）、生物气候变量（bio1至bio19）及地形变量（t01_alt海拔等）
数据来源
论文“Disentangling the effects of geographic peripherality and habitat suitability on neutral and adaptive genetic variation in Swiss stone pine”
适用场景
- 植物种群遗传学研究：分析瑞士石松中性与适应性遗传多样性的分布模式及驱动因素
- 地理边缘性效应评估：探究物种分布边缘种群的遗传多样性特征及形成机制
- 栖息地适宜性与遗传关联分析：研究生态位适宜性对种群适应性遗传变异的影响
- 气候变化适应研究：基于环境变量与遗传数据，预测物种对气候变化的适应潜力
- 保护遗传学应用：为瑞士石松濒危种群的保护策略制定提供遗传数据支持
