数据集概述
本数据集是论文“Placozoa系统基因组学与首个高级分类”的补充资料，包含扁盘动物门（Placozoa）的基因组学、形态学及分类学相关数据。通过7个关键基因组的蛋白质序列分析，构建了首个核系统基因组重建，提出了完整的林奈分类系统，涉及新类群命名及进化关系分析。数据集共11个文件，涵盖系统发育树、基因注释、形态学文档等内容。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：
README.md、Supplementary_Data_3_Morphology.docx、Supplementary_Table_1_Outgroups.docx
- 文件格式：MD、DOCX
- 字段映射介绍：
README.md说明数据集内容；Supplementary_Data_3_Morphology.docx含形态学数据；Supplementary_Table_1_Outgroups.docx记录外类群信息。
- 表格类文件
- 文件名称：
Supplementary_Data_5_Unique_Genes.xlsx、Supplementary_Table_2_Genome_Statistics.xlsx、Supplementary_Data_2_OG_Annotations_wConsensus.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含独特基因列表、基因组统计数据、直系同源群注释等表格数据。
- 压缩包文件
- 文件名称：
Supplementary_Data_4_GO_tables.zip、Supplementary_Data_1_Phylogenomic_Matrix.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：GO注释表格压缩包、系统基因组矩阵压缩包。
- 图像类文件
- 文件名称：
Supplementary_Figure_2_Photos.tiff、Supplementary_Figure_1_Only_Molecular.tiff
- 文件格式：TIFF
- 字段映射介绍：含扁盘动物照片及系统发育树图像。
- 矩阵类文件
- 文件名称：
Supplementary_Data_6_Gene_Content_Presence_Absence_Matrix.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：基因内容存在-缺失矩阵，包含菌株及基因家族的存在缺失信息。
数据来源
论文“Phylogenomics and the first higher taxonomy of Placozoa, an ancient and enigmatic animal phylum”
适用场景
- 扁盘动物门分类学研究：用于分析扁盘动物门的高级分类系统，验证新命名类群的合理性。
- 基因组进化分析：通过基因存在-缺失矩阵及注释数据，研究扁盘动物门的基因内容演变及分化时间。
- 形态学与基因组学关联研究：结合形态学文档与基因组数据，探讨扁盘动物门形态与遗传特征的关系。
- 动物进化关系研究：利用系统发育树数据，分析扁盘动物门与其他动物类群（如海绵、栉水母）的亲缘关系。
- 基因功能注释分析：通过GO注释表格，研究扁盘动物门基因的功能分类及独特基因的生物学意义。
