数据集概述
本数据集为植物-丛枝菌根真菌(AMF)空间共现网络研究相关数据,包含空间存在数据、非生物空间数据及分析代码等。研究通过信息理论方法和空间显式物种数据,结合考虑空间效应的零模型,分析网络结构,发现其缺乏实质性结构,共现多由随机性解释。
文件详解
- 代码文件
- 文件名称:mutual_info_cluster.R、null_models_plant_amf_co_occurrence.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:包含基于信息理论的网络分析代码、考虑空间效应的零模型实现代码,用于处理和分析植物-AMF共现数据
- 压缩数据文件
- 文件名称:mycorrhiza_spatial_presence_data.zip、plant_spatial_presence_data.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:分别存储菌根真菌和植物的空间存在数据,为空间显式的物种水平数据
- 非生物数据文件
- 文件名称:abiotic_spatial_data.dat
- 文件格式:DAT
- 字段映射介绍:包含研究区域的非生物空间数据,用于网络分析的环境因素参考
数据来源
论文“Data from: Plant-mycorrhizal fungus co-occurrence network lacks substantial structure”
适用场景
- 植物微生物互作网络分析: 研究植物与丛枝菌根真菌的空间共现模式及网络结构特征
- 生态系统随机性与确定性过程研究: 分析空间效应下物种共现的驱动机制,区分随机性与专业化互作的作用
- 空间生态学建模: 基于空间显式数据和零模型方法,构建植物-微生物互作的空间生态模型
- 信息理论在生态网络中的应用: 探索信息理论方法在分析物种共现网络中的实践价值