Plasmodium_Based_塞内加尔Thiès地区恶性疟原虫基因组监测数据集

数据集概述

本数据集为塞内加尔Thiès地区恶性疟原虫基因组监测研究结果,包含70名参与者四年纵向数据,通过24个单核苷酸多态性分子条形码分析寄生虫遗传相似性,结合地理信息系统数据揭示家庭内寄生虫聚类、遗传相似性随距离下降等特征,支持疟疾传播趋势与模式监测。

文件详解

  • 说明文件
  • 文件名称:SY_ET_AL_Readme.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含数据集标题、作者信息(主要研究者及机构)、研究背景与方法概述等元数据
  • 数据文件
  • 文件名称:Pairwaise_barcode_comparaison_GPS_Longitudinal_dryad.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含单核苷酸多态性分子条形码比对数据、地理信息系统(GPS)数据及纵向监测记录,用于分析寄生虫遗传与空间关系
  • 数据文件
  • 文件名称:Figure_1_Barcodes_Longitudinal_dryad.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含图1对应的条形码纵向监测数据,记录不同时间点寄生虫遗传特征变化

数据来源

耶鲁公共卫生学院Amy K. Bei团队研究

适用场景

  • 疟疾传播监测:分析低传播地区(EIR<1)恶性疟原虫的时空传播趋势与家庭聚类特征
  • 寄生虫遗传结构研究:通过遗传相似性数据探究寄生虫种群结构与传播强度的关联
  • 防控策略评估:结合基因组数据与传统流行病学方法,评估疟疾控制措施的有效性
  • 传播热点识别:利用遗传与空间数据定位疟疾传播热点区域,支持精准干预
  • 家庭传播溯源:针对高遗传多样性家庭开展传播来源调查,优化消除策略
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.06 MiB
最后更新 2026年1月15日
创建于 2026年1月15日
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