数据集概述
本数据集为PLOS Biology期刊文章《Public human microbiome data are dominated by highly developed countries》的补充数据，包含人类微生物组样本的国家分布、样本标签统计、生物样本元数据等核心内容，支持研究全球人类微生物组公开数据的地域分布特征。
文件详解
- 文档说明文件：
- README.txt：TXT格式，说明数据集文件结构、各文件内容及字段定义，包含补充表和数据集的详细描述
- figures.md：MD格式，可能为图表生成说明文档
- 补充表格文件（CSV格式）：
- supp_table01.csv：样本标签统计，字段包括tag（生物样本标签名）、samples（含该标签的样本数）、coverage（标签覆盖样本比例）
- supp_table02.csv：不同身体部位样本的国家分布统计，包含gut（肠道）、oral（口腔）、skin（皮肤）、vaginal（阴道）、lung（肺部）等部位的国家样本数
- supp_table04.csv：补充表4（具体内容未完全展示）
- country_counts.csv：国家样本数量统计
- region_years.csv：区域年度样本分布数据
- acceptable_hosts.csv：可接受的宿主列表
- 样本数据文件（CSV格式）：
- samples.csv：人类微生物组样本元数据，字段包括srs（样本ID）、host（宿主）、source（样本来源）、srr（测序ID）、project（项目ID）、library_strategy（测序策略）、geo_loc_name（地理位置）等
- 压缩文件：
- biosample_data.zip：生物样本数据压缩包
- code.zip：分析代码压缩包
- 图表文件：
- figures_assembled.pdf：PDF格式，已整合的研究图表
数据来源
PLOS Biology期刊文章《Public human microbiome data are dominated by highly developed countries》（Abdill et al. 2022）
适用场景
- 微生物组研究：分析全球人类微生物组公开数据的地域分布特征，比较不同国家/地区样本数量差异
- 数据公平性研究：探究高收入国家与其他国家在微生物组数据贡献上的差距
- 生物样本库分析：统计不同身体部位（肠道、口腔、皮肤等）微生物组样本的国家分布规律
- 科研数据资源评估：评估全球人类微生物组公开数据的覆盖范围与代表性
